برامج معالجة الصور العلمية

عندما يحصل أحد على صورة فإنه يهتم بعرضها وتعديلها وتحسين الخصائص اللونية في الصورة كالتباين. وهذا تقوم فيه مجموعة كبيرة جدا من البرامج. غير أن الباحثين عندما يحصلون على صورة فإنهم يهتمون أيضا ببعض الأمور الأخرى كالأحجام للأشياء الموجودة في الصورة والإرتفاعات من خلال التباين اللوني.العديد من البرامج تستخدم في تظهير البيانات ومعالجتها للصور العلمية كالصور من المجاهر الماسحة. هذه البرامج تستخدم تحرير وتصحيح الصور والمعالجة اللونية بالإضافة إلى التحليل الإحصائي للبيانات المستخرجة من الصور و تحليل الحبيبات والتكتلات الحبيبية وتحويلات فورير وذلك لدراسة الترددات الطيفية في بيانات المجهر الماسح. البرامج توفر قياسات علمية في لأشياء في الصور كالأبعاد والحجوم والإستضاءة ونحوها للتكتلات والأشكال، إضافة إلى خصائص أخرى كثيرة .

• إميج جي ImagJ تحت رخصة مشاعة  وله العديد من التفريعات ومطور ابتداءا من المعاهد الوطنية للصحة NIHالأمريكية. المطور الرئيسي للبرنامج وين راسباند  Wayne Rasband عمل ل40 سنة في كمطور برامج في معاهد الصحة الوطنية وتقاعد 2010 لكنه استمر يدير موقع البرنامج. البرنامج قائم على جافا لذا فهو يعمل على جميع المنصات كالويندوز والماك واللينيكس. البرنامج مشهور في تحليل الصور الحيوية وفيه قائمة ضخمة من الفلاتر والماكرو والإضافات متاحة من مجتمع التصو ير من جميع انحاء العالم. هذه القائمة الكبرى من الإضافات تمكن الباحث من التعامل مع بكفاءة مع الصور واستخراج مايرغب منها.  إن إي أتش أيمج NIH Image برنامج معد للماك وهو الملهم لكثير من البرامج التي أتت بعده. الشكل التوضيحي في الأسفل يبين التاريخ لهذه البرامج ومجموعة من البرنامج المرتبطة بـ إيمج جي.

رابط البرنامج : rsb.info.nih.gov/ij/index.html و مستندات أخرى للبرنامج يمكن أن توجد هنا على :  imagejdocu.tudor.lu/

• إيميج إس إكس إم ImageSXM نسخة من إيمج جي معدة لتحميل وعرض وتحليل صور المجاهر الماسحة.

الرابط للبرنامج هنا www.liv.ac.uk/~sdb/ImageSXM/

• إيمج جي 2 ImageJ2 نسجة جديدة من إيمج جي 1 يدعم بيانات الصور العلمية متعددة الأبعاد Multidimensional Image Data

رابط البرنامج imagej.net/ImageJ2

• فيجي FIJI : يتضمن إميج جي1 ImagJ1 و إيمج جي 2 ImageJ2 لكن بنسخة منسقة وتحديثات آلية مع مجموعة من الإضافات المختبرة و توثيق جيد.  رابطه هنا : fiji.sc/Fiji

شكل يوضح التسلسل التاريخي للبرامج المتفرعة من إيمج جي والبرامج المرتبطه به. المصدر : http://fiji.sc/ImageJ

البرامج السابق هي برامج تحتوي برنامج إيمج جي مع بعض الإضافات والتحسينات إذا كنت مختصا علميا ربما ترغب بقراءة هذه الورقة

 Schindelin, J.; Rueden, C. T. & Hiner, M. C. et al. (2015), "The ImageJ ecosystem: An open platform for biomedical image analysis", Molecular Reproduction and Development, PMID26153368

البرامج اللاحقة هي برامج مستقلة عن إيمج جي وهي :

• سيل بروفيلر CellProfiler برنامج مفتوح المصدر لمعالجة عدد كبير من الصور دفعة واحدة موجه للصور الحيوية رابطه www.cellprofiler.org/

• جوديون Gwyddion : برنامج  مفتوح المصدر لمعالجة واظهار وتحليل صور المجاهر  المجسية الماسحة مثل مجهر القوة الماسح AFM وغيره كـ  ( MFM, STM, SNOM/NSOM) . هذا البرنامج لإظهار ومعالجة الصور ولقياس الإرتفاعات في الصورة. يدعم العديد من عمليات المعالجة وصيغ الصور . يمكنك ايضا من دراسة تأثير المجس على العينة من خلال متابعة الأنماط على الصور وبعد معرفة خصائص المجس. رابطه gwyddion.net

• أيسي Icy : برنامج مفتوح المصدر من معهد باستور برز لقابليته العالية للاستخدم وجمالية واجهة البرنامج يمكنك أن تستخدم إميج جي ImagJ مضمنا مع هذا البرنامج. وفية الكثير من الإضافات التي يمكن أن تلحق به .  رابط البرنامج :icy.bioimageanalysis.org/index.php

نشير إلى أن بعض هذه البرامج تحتوي إضافات تمكن المستخدم من ربطها بماتلاب Matlab ومجموعة من البرامج الأخرى.كما ن ماتلاب على سبيل المثال يحتوي صناديق أدوات مضافة يمكن أن تستخدم في معالجة الصور لكن ليس بنفس سهولة وتخصيص البرامج السابقة.

التبديل بين زر رفع الصوت وخفضه باستخدام كي تويك KeyTweak

يوغا 13 محمول جميل بمواصفات جيدة. يعيبه شيئان الأول الحرارة المرتفعة نسبياً وصغر حجم الذاكرة. واجهت مشكلة في الجهاز وهي أن مؤشر الصوت يرتفع باستمرار كما في الصورة السفلى وبالتالي يمنع من استخدام لوحة اللمس Touchpad ويمنع من الإنتقال بسهولة بين النوافذ. أتوقع أن المشكلة بأزرار الصورت من الجانب الأيسر. فإذا ضغطت على الجانب الأيسر بطريقة معينة ذهبت علامة الصوت من الشاشة وتمكنت من التبديل بين النوافذ.

مؤشر الصوت يرتفع باستمرار

بعد محاولات متعددة وفتح الجهاز قررت أن ألغي تفعيل الزر الذي يرفع الصوت. أيضا الجهاز يبدل بين رفع الصوت وخفضه . فزر رفع الصوت يخفض الصوت وزر خفض الصوت يرفع الصوت ولتجاوز هذا العقبة يمكن القيام بها من البيوس (نظام الإدخال والإخراج الأساسي) BIOS  أو القيام بها من برنامج كي تويك KeyTweak .

واجهة برنامج كي تويك KeyTweak

في البرنامج لو ضغطت على زر رفع الصوت سيظهر لك رقم المفتاح وهو 129 ولو ضغطت خفظ الصوت سيظهر لك الإسناد لـ 131. للتبديل بينهما اختر زر رفع الصوت >> ثم من المنسدلة المعنونة بــ Choose New Remapping إختر Volume Down ثم زر Remap Key  بعد ذلك إضغط زر خفض الصوت من الأزرار العلوية بالجهة اليمنى وسيظهر لك الإسناد 131 ثم من القائمة المنسدلة بــ Choose New Remapping إختر Volume Up ثم زر Remap Key  ثم اضغط تطبيق.

أما إذا أردت ان تعطل أي زر فأضغط الزر الذي تريد تعطيله ثم اضغط Disable Key . وإن رغبت باستعادة الأزرار إلى الوضع الأولي فأختر الزر العلوي Restore All Defaults .

بعد تعطيل زر اصوت لأعلى أمكنني التغيير بين النوافذ وهذا مهم بالنسبة لي، لكن لوحة اللمس أصبحت متعطلة وهذا غير مهم كثيرا بالنسبة لي لأنني استخدم الفأرة. إذا كنت تعرف علاج هذه المشكلة ليتك تسعفني بها لأنني بحثت كثيراً في المواقع والمحلات ولم أجد لها حلاً.

إضافة الخط الأميري في مدونات بلوقر

الخط الأميري من أجمل الخطوط للكتابة العربية وبالذات في النصوص الطويلة والكتب. ومطوره الطبيب خالد حسني [khaledGhetas@] الذي يقول عنه “الخط الأميري هو إحياء و محاكاة للخط الطباعي الجميل الذي تميزت به مطبعة بولاق منذ أوائل القرن العشرين، و التي عرفت أيضا بالمطبعة الأميرية، و من هنا أخذ الخط اسمه.”[amirifont.org].

لإضافة هذا الخط إلى مدونة بلوقر لمن لا هو مثلي لا يجيد أكواد HTML ولا CSS، اضغط على زر

 1. قالب|Template ثم >> تخصيص ثم >> متقدم >> ثم >> إضافة CSS >> ثم الصق الكود التالي واضغط على [تطبيق على المدونة]:

@font-face { font-family: 'Amiri';
 font-style: normal;
 font-weight: 400;
 src: local('Amiri'), local('Amiri-Regular'),
 url(http://fonts.gstatic.com/s/amiri/v7/7uGqdnOlOhcFsG_5_cvW9A.woff2) format('woff2'), url(http://fonts.gstatic.com/s/amiri/v7/D_PVP9E1Aq8vyzac0KeksA.woff) format('woff');
 }
@font-face { font-family: 'Amiri';
 font-style: normal;
 font-weight: 700;
 src: local('Amiri Bold'), local('Amiri-Bold'),
 url(http://fonts.gstatic.com/s/amiri/v7/mmHwJz0KRs9eU5Fnp3rH_vesZW2xOQ-xsNqO47m55DA.woff2) format('woff2'),
url(http://fonts.gstatic.com/s/amiri/v7/nO3N_1h-pW60LUWtaG4Bs_esZW2xOQ-xsNqO47m55DA.woff) format('woff');
}
 @font-face { font-family: 'Amiri';
 font-style: italic;
 font-weight: 400;
 src: local('Amiri Slanted'), local('Amiri-Slanted'),
 url(http://fonts.gstatic.com/s/amiri/v7/-lr-LWHMSMdNwvzVms9K_g.woff2) format('woff2'),
 url(http://fonts.gstatic.com/s/amiri/v7/A2heUVapL2_UIIJmxv5OFA.woff)
 format('woff');
 }
@font-face { font-family: 'Amiri';
 font-style: italic;
 font-weight: 700;
 src: local('Amiri Bold Slanted'), local('Amiri-BoldSlanted'),
 url(http://fonts.gstatic.com/s/amiri/v7/l_NsyFgdaG0LOV95cZUpq_k_vArhqVIZ0nv9q090hN8.woff2)
 format('woff2'),
url(http://fonts.gstatic.com/s/amiri/v7/l_NsyFgdaG0LOV95cZUpqxsxEYwM7FgeyaSgU71cLG0.woff) format('woff');
}

ثم بعد ذلك اضغط قالب واختر >> تحرير HTML  ثم ابحث عن font-family أو font family ستجد داخل القوس مجموعة من الخطوط أو ربما خط واحد. ضع ‘Amiri’ على هذه الصيغة

font-family: 'Amiri', serif; 

 ربما تكون تحت إسم المتغير body font أو Page  أو Page font

هذه أمثلة من مدونات مختلفة أضفت اللون الأحمر فقط :

     <Variable name="body.font" description="Font" type="font"
         default="normal normal 15px 'Amiri', Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans" value="normal normal 15px Amiri, Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, serif"/>
     <Variable name="body.text.color" description="Text Color" type="color" default="#333333" value="#333333"/>

 هذا مثال آخر :

Group description="Body Text" selector="body">
     <Variable name="body.font" description="Font" type="font"
         default="normal normal 16px 'Amiri',Droid Arabic Naskh, Tahoma,Arial, Helvetica, FreeSans, serif" value="normal normal 20px Amiri, serif"/>
     <Variable name="body.text.color" description="Text Color" type="color" default="#666666" value="#525252"/>
   </Group>

مثال ثالث:

  <Group description="Page">
     <Variable name="page.text.font" description="Font" type="font"
         default="'Amiri', HelveticaNeue-Light, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, serif" value="'Amiri', HelveticaNeue-Light, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, serif"/>
     <Variable name="page.text.color" description="Text Color" type="color"
         default="#333333" variants="#333333" value="#333333"/>
     <Variable name="body.background.color" description="Background Color" type="color"
         default="#EEEEEE"
       variants="#dfdfea,#d9f4f4,#e4f2eb,#e9ead9,#f4eed9,#fdead9,#f8e3e0,#fdebed,#ebe5e3" value="#dfdfea"/>
   </Group>

مثال رابع :

body { margin:0; padding:0; background:$pagebgcolor url(https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjgzysjxpb08OTd7X74tZhyphenhyphenZqEhLex_AdaE3lmwvR1vUFl0nNEHfLImmKFJt9hfyAEr9egrDyukxiDy41H6OSwiYA7zEFs0QMseXYfA_v2VijilzUruONj5j1YnEcIk8QhSbsX-nHeIiSo/s1600/topuc.gif) repeat-x 0 -30px; font-family: 'Amiri', Tahoma, arial; text-align:center; font-size:12px ,serif}

وبهذا تظهر مدونتك بالخط الأميري.

ينصح بعدم إضافة الكثير من الخطوط في القالب حيث أن هذا يؤثر على سرعة تحميل المدونة.
علما أن شكل الخطوط يعتمد على عوامل عديدة منها المتصفح الذي تستخدمه.

إزالة موقع النادي

موقع النادي يعتبر خاطف متصفح [browser hijacker] ، يسوق موقع النادي مع بعض البرامج المجانية مثل HD Streem  وغيره من البرامج وذلك عن طريق الضغط على بعض الإعلانات . النادي لايعتبر فايروس لكن له نشاطات خبيثة ويسوق بالنوافذ المنبثقة ويوجه بحثك ويجعل موقعه الصفحة الرئيسية لمتصفحك.

هناك الكثير من البرامج اللتي تزعم إزالته بعضها يعمل وبعضها لا ينفع.

لإزالة البرنامج من متصفحك

أولا : إذهب إلى لوحة التحكم Control panel >> ثم البرامج والخصائص Program and Features >> ثم أحذف البرامج أو أشرطة الادوات المشكوك فيها أو التي تسبب تنزيلها بظهور موقع النادي لك.

ثانياً: إحذف الإضافات المشبوهة من متصفح الذي تستخدمه .

ثالثاً: لحذف المدخل النادي alnaddy من السجل ( الريجستري ) Registry ابحث عن regedit  من بحث ويندوز ثم اضغط Ctrl+F  وابحث عن كلمة alnaddy وأحذف السجل الخاص بها.

رابعا : إذهب إلى قائمة البرامج وابحث عن أيقونة المتصفح الذي تستخدمة وتريد إزالة موقع النادي منه.

2. إضغط على أيقونة البرنامج بزر الفارة الأيمن >> ثم أضغط خصائص  إضغط على أيقونة البرنامج ثم أختر خصائص Properties >> ثم اضغط على [افتح موقع الملف open file location ]. كما في الصورة التي في الأسفل:

3.إذا فتح لك موقع الملف اضغط على أيقونة البرنامج  بالزر الأيمن للفارة ثم أختر خصائص Properties >> ثم من لسان إختصار Shortcut

سوف تجد كهذا الرابط :

"C:\.......\iexplore.exe" http://www.alnaddy.com/?src=links-3

4. من حقل الهدف Targetاحذف الرابط الذي يوجه لموقع النادي http://www.alnaddy.com/?src=links-3 .
إذا كان لديك إختصار للبرنامج على سطح المكتب أو قائمة ابدأ اضغط أيضا أيقونة البرنامج  بالزر الأيمن للفارة ثم أختر خصائص Properties >> ثم من لسان إختصار Shortcut و احذف ايضا الرابط الذي يوجه لموقع النادي.
لتغيير الصفحة الرئيسية من موقع النادي إلى موقع آخر اضغط في متصفح اكسبلورر إذهب إلى خيارات الإنترنت Internet options >> ثم من لسا عام General >> ضع الصفحة الرئيسية التي تريدها أن تكون لك. كهذه الصورة: 

لتغيير الصفحة الرئيسية من موقع النادي إلى موقع آخر اضغط في متصفح كروم إذهب إلى إعدادت Settings >> ثم في البدء On startup >> عند علامة إفتح صفحة محددة أو مجموعة من الصفحات Open a specific page or set of pages >> اضغط Set pages >> ثم أحذف المواقع الغير مرغوبة وادخل الموقع الذي تريد أن يكون محرك البحث لك أو الصفحة الرئيسية .

إدراج صندوق الأكواد في بلوجر

مربع الأكواد Code Box يستخدم غالبا في كتابة الأكواد ولإضافة هذا النوع لمدونات بلوجر إذهب إلى قالب >> ثم تخصيص >> ثم متقدم >> ثم إضافة CSS ثم الصق الكود  التالي:

.code { background:transparent;

background-repeat:no-repeat;

border: solid #888888;

border-width: 1.5px 1.5px 1.5px 2px;

color: #222222; font: 16px 'Courier New', Courier, monospace;

line-height: 18px; margin: 10px 0 10px 10px; max-height: 200px;

min-height: 20px; overflow: auto; padding: 10px 10px 10px;

width: 80%; }

.code:hover { background: #f3f3f3; background-repeat:no-repeat; }

ثم بعد ذلك إضغط على زر [تطبيق على المدونة]كما هو مبين في الصورة السفلى :

بعد ذلك عندما تريد أن تكتب تدوينة جديدة وتريد أن تضمنها صندوق أكواد أو مربع كود فأذهب أيضا إلى وضع HTML  بدلا عن تأليف وضع الشفرة التالية:

<div class="code"> ضع النص هنا أو الكود المراد كتابته < /div>

عندما تضع الكود داخل الصندوق أو الحقل، أي في مكان (ضع النص هنا أو الكود المراد كتابته) فإنك بالغالب تحتاج للتخلص من بعض الرموز  في HTML وهذا ببساطة عن طريق لصق الكود هنا أو هنا أو غيرهما من المواقع التي تحول لغة ترميز النص الفائق(إتش تي إم إل ) الخام إلى ما يسمى  Escaped HTML .
بعد ذلك تأخد الكود المحسن وتلصقه .

إضافة حقل نص في بلوجر

في مدونات بلوجر يمكن إضافة مربع نص ببساطة إلى  التدوينة بالضغط على زر HTML  بدلا من تأليف ثم إضافةالكود التالي:

<textarea name="textarea" resize: none; rows="5" cols="50"> أدخل النص أو الكود هنا </textarea>

حيث أن raws هو عدد الأسطر يعني الأرتفاع و Cols الأعمدة وتقابل العرض هنا. ومن ثم تدخل النص أو الشفرة التي تريد كتابتها كما هو موضح في الأعلى.

أنظر الصورة للتوضيح:

جعل نظام ويندز نظام التشغيل الافتراضي

لتجعل ويندوز النظام الاساسي اذا كان عندك نظامين تشغيل:
لنظام ويندوز و  سينتوس(CentOs)  وهي توزيعة من لينكس: 
في الاقلاع ،
في شاشة الأومر
su
أدخل الرمز السري
ثم
gedit /boot/grub/menu.lst
يمكن أن تضع بدل gedit
vi
أو ضع اسم  محرر النصوص الذي تستخدمه.
عدل

default=0
ربما تجد قيمته 0 ، ضعها حسب ترتيب  نظام ويندوز  عندما تبدأ الاقلاع ( ربما 2 أو 4) لا حظ أن الترتيب يبدأ من 0 ،1 ،2 ، فإذا وضعت 2 يعني ترتيب ويندوز 3.
2= default
timeout=5
ممكن تغير وقت الانتظار لاختيار نظام التشغيل إلى أكثر من خمس ثواني بتغييرها من timeout 
اضغط حفظ وأغلق

حذف النسخ/الاصدارت الأقدم من سينتوس

في نظام لينكس توزيعه سينتوس CentOs ، عندما تحدث النظام مستخدما  مثلا :
----
su
الرمز السري
yum update
----
مع الوقت يكون  في الجهاز أكثر من كيرنل(نواة تشغيل ). لتحذف باقي الانويه وتجعل أخر نواتين في الجهاز فقط (موصى به لوحدثت لديك مشكله يمكنك الرجوع الى الاصدار الأقدم ) .
su
ادخل كلمة السر الخاصه بك
yum install yum-utils
package-cleanup --oldkernel
لاحظ مسافه بين cleanup و oldkernel
سيحذف البقيه ويبقي اثنين فقط .
-----
لحذف كيرنل محدد :
yum remove kernel
بعد كلمة
kernel
أدخل رقم النواة مباشرة  مثلا:
kernel-2.6.18-128.1.6.el5
ربما تنطبق على توزيعات  ردهات وفيدورا

استخدام الأرقام العربية ( الهندية ) في متصفح فيرفوكس

تتميز الكتابة العربية بتناسقها مع الرقم العربي الذي يدعوه البعض بالهندي. ولتغيير الأرقام من الأرقام اللاتينية إلى العربية في متصفح فايرفوكس أدخل في الشريط العلوي من المتصفح about:config ،ثم اضغط على زر !I'll be careful, I promise  .
في شريط البحث العلوي أدخل "bidi.numeral " ثم اضغط عليها مرتين وأدخل رقم 2 .
ستكون الأرقام عربية في حالة الكتابة العربية وأرقام لاتينية في حالة كانت الكتابة بحروف لاتينية.

مشكلة الوصول إلى المدونة من ويندوز رايتر

إذا كنت تستخدم منصة التدوين بلوقر ، فربما تجد خلال محاولة تسجيل الدخول إلى مدونتك من ويندوز رايتر [Windows Live Writer] ، بعدم تمكنك من الدخول وتظهر رسالة  تخبرك بأن كلمة السر أوأسم المستخدم غير صحيح. وتطالبك بإعادة المحاولة. 

والسبب يعود إلى منع قوقل لبعض التطبيقات من الوصول إلى حسابك في قوقل لمزيد من الأمان. لتتمكن من الدخول وتسجيل مدونتك

1.تأكد من تسجيل الدخول في حسابك في جوجل .

2. إنسخ الرابط التالي وألصقه في متصفحك :

https://www.google.com/settings/security/lesssecureapps

ستظهر قائمة بعنوان Less secure apps أو إذا كنت تستخدم العربية ستكون بعنوان التطبيقات الأقل أماناً.

3. اختر Enable  أو تشغيل كما في الصورة السفلى ثم أغلق اللسان Tab .

4. عد إلى حساب ويندوز لايف رايتر وسجل الدخول.

البداية بسطر جديد داخل نفس الخلية في إكسل

في برنامج الإكسل من مايكروسف أوفيس عندما تضغط Enter  فإن التظليل ينتقل بك إلى الخلية التالية. عندما ترغب ببدء سطر جديد داخل نفس الخلية يمكنك فعل ذلك بوضع المؤشر على نهاية السطر داخل الخلية ثم الضغط على  Alt  +  Enter

ماذا تحتوي هذه المدونة ؟

تحتوي هذه المدونة على حلول لمشاكل ممرت بها غالبا ماتكون تقنية بحثت عنها ووجدت الجواب في مواقع أجنبية وربما تحتوي أشياء أخر ....